基于全表观组关联分析的植物表观元件挖掘方法及其在植物分子育种中的应用

本发明公开了基于全表观组关联分析的植物表观元件挖掘方法及其在植物分子育种中的应用，其中方法通过关联DNA甲基化与数量性状，挖掘不同甲基化自然变异对表型的影响。该方法包括以下步骤：(1)采集种质资源群体材料的表型数据；(2)采集种质资源群体材料的基因组DNA，用于构建重亚硫酸盐文库并测序以获取群体DNA甲基组数据；(3)利用滑动窗口法将基因组分成固定长度的窗口，并根据甲基化水平对窗口分型；(4)使用混合线性模型对窗口的分型与表型数据进行关联分析，确定与表型显著相关的窗口。上述方法可以挖掘负责群体表型变异的表观遗传位点或元件，为植物分子育种提供表观等位基因资源。