基于3D结构与多层次注意力机制的药物靶标预测方法

本发明提供一种基于3D结构与多层次注意力机制的药物靶标预测方法，属于药物靶标预测技术领域；所要解决的技术问题为：提供一种基于3D结构与多层次注意力机制的药物靶标预测方法；采用的技术方案为：收集有关药物、靶点序列和药物靶蛋白之间的相互作用标签的数据信息，对药物的SMILES字符串特征进行处理和提取；使用卷积神经网络对数值化后的蛋白质氨基酸序列进行学习，经过多层的卷积和池化操作完成靶点在序列上的特征编码，提取靶点序列特征数据；读取PDB文件建模成口袋图，对口袋图进行特征计算，生成最终的蛋白质结构表示编码，通过对PDB文件建模来提取靶点蛋白的结构特征数据；本发明应用于药物靶标预测。