一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统

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一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统
申请号:CN202510361237
申请日期:2025-03-26
公开号:CN119889440B
公开日期:2025-06-06
类型:发明专利
摘要
本发明公开了一种基于扩散模型的三维空间测序插值方法及系统,该方法包括:基于空间邻域关系构建细胞微环境图,建立细胞位置与基因表达的关联网络;通过随机微分方程建模细胞位置及基因表达随深度的连续动态变化;利用图神经网络学习空间梯度,分别预测形状漂移系数和表达漂移系数;采用双向推断策略联合优化插值结果,通过Wasserstein距离和均方误差约束形状与表达的对齐精度;整合插值切片生成连续三维转录图谱。本发明通过融合扩散模型与图神经网络,实现对z轴切片数据的连续性补全,实现了对组织三维基因表达的高分辨率重建,可精准解析肿瘤边界、脑区功能分区等复杂空间生物学问题,为病理诊断、发育研究和药物开发提供关键技术支撑。
技术关键词
空间邻域关系 切片 深度连续变化 插值方法 基因表达图谱 方程 KNN算法 坐标 数据 网络 插值系统 转录组学 组织 K近邻 连续体 矩阵 模块 误差 重构
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