一种中草药-基因关联关系预测方法、系统及存储介质

本发明公开了一种中草药‑基因关联关系预测方法、系统及存储介质，涉及生物信息技术领域。将中草药成分转化为分子图，生成初始成分子结构特征；通过子结构感知网络对初始成分子结构特征进行优化，得到目标成分子结构特征；将基因序列分割为若干个子序列，并构建k‑mers图，得到基因子序列特征；通过多层级特征融合，将目标成分子结构特征与基因子序列特征进行聚合；计算成分嵌入表示和基因嵌入表示间的联合概率分布，得到预测关系。本发明基于核心子结构感知的中草药‑基因关联关系预测方法，不仅提取基因序列特征，还提取中草药成分的结构特征，充分考虑了中草药成分和基因的结构信息，关联关系的预测结果更加准确，且具有较高的普适性。