基于scATAC-seq的ecDNA结构预测方法和识别携带ecDNA细胞的方法及介质

本发明提供了一种基于scATAC‑seq的ecDNA结构预测方法和识别携带ecDNA细胞的方法及介质，涉及生物信息技术领域。本发明基于scATAC‑seq的ecDNA结构预测方法，通过与参考基因组对比提取ecDNA断点来源的不一致读数，并依次调用富集的峰区域，并将其转换为图和断点图结合贝叶斯模型，实现ecDNA断点、ecDNA区域以及连接方式等结构信息的精确预测。本发明还提供了识别携带ecDNA细胞的方法，该方法对于上述基于scATAC‑seq的ecDNA结构，利用标准化处理，以及形成基因活性矩阵，通过非单峰检验，携带ecDNA细胞的精确获取。本发明可预测ecDNA结构并精准识别携带ecDNA的细胞，可应用于精准解析和研究ecDNA在肿瘤异质性、进化和耐药过程。